El proyecto consiste en la catalogación de las colecciones históricas del cliente, donde se reúnen distintos tipos de materiales: documentación manuscrita, partituras y monografías impresas, publicaciones periódicas, registros sonoros y audiovisuales. El Centro es, por tanto, una combinación compleja de archivo histórico, biblioteca de investigación, fonoteca y museo de instrumentos. 

La dirección de la biblioteca es responsable del control integral de colecciones de libros de música y partituras ingresados por compra, donativo o Depósito. En este Departamento se realizan todas las tareas relacionadas con la adquisición, preservación y procesamiento técnico de los documentos: clasificación, catalogación bibliográfica, catalogación de registros de autoridad y de fondos dentro del catálogo. En los últimos años el Departamento ha hecho un enorme esfuerzo de incremento de sus colecciones y también de incorporación de todos sus documentos musicales al catálogo automatizado, consultable a través de la Web de la Biblioteca, pero todavía existen colecciones de documentos pendientes de completar su procesamiento.

 La colección, es una de las más importantes de la especialidad en España, con un fondo estimado actualmente en más de 135.000 volúmenes, de los cuales no menos de 10.000 son partituras manuscritas de los siglos XVIII y XIX.

Actualmente se incorporan a nuestra biblioteca entre 1.500 y 2.000 libros y partituras cada año, siempre dentro del ámbito de la música de tradición escrita. Desde la fundación su colección ha sido considerada por la mayoría de los músicos y bibliotecarios españoles la biblioteca musical por excelencia, y en ella se han reunido numerosas aportaciones de personas y entidades particulares (orquestas, sociedades filarmónicas, etc.) junto a colecciones procedentes de iniciativas oficiales: fondos del Registro de la Propiedad Intelectual, Depósito Legal, documentación procedente de instituciones eclesiásticas desamortizadas, colecciones donadas por miembros de la Familia Real, etc.